As possíveis complicações associadas à punção endoscópica gastrointestinal de cistos ou pseudo-cistos incluem dor, abscesso, hemorragia / sangramento, pancreatite, perfuração com pequeno risco de infecção, dor abdominal, distúrbios de coagulação e contra-indicações relacionadas ao uso de bisturi elétrico, reação alérgica a medicamentos, reação alérgica a níquel, hipotensão, depressão ou parada respiratória, arritmia ou parada cardíaca, coagulação