A ciszták vagy pszeudociszták gasztrointesztinális endoszkópos punkciójához kapcsolódó lehetséges szövődmények: fájdalom, tályog, vérzés, hasnyálmirigy- gyulladás, perforáció, kis fertőzési kockázat, hasi fájdalom, koagulációs zavarok, az elektromos szike használatával kapcsolatos ellenjavallatok, gyógyszerallergia, nikkelallergia, alacsony vérnyomás, légzésdepresszió vagy -leállás, szívritmuszavar vagy szívleállás.
