Les contre-indications comprennent, sans s’y limiter, un état général médiocre tel qu’une insuffisance respiratoire, un risque d’aspiration, des troubles généraux de la coagulation du sang et de la cicatrisation, une sténose asymptomatique ou un ictère, une sténose endoscopiquement impassible, une pancréatite aiguë non biliaire, le consentement du patient absent. Le dispositif n’est pas indiqué dans le cadre d’interventions pédiatriques.