A biopsziás fogók használatához kapcsolódó összes szokványos ellenjavallat az egyszer használatos G-Flex biopsziás fogók használatára is érvényes. Ezek közé tartoznak a következők:
A gyomor-bélrendszerrel kapcsolatban:
Peritonitis, a bélfal fragilitása (pl. fekélyes vastagbélgyulladás, divertikulitisz, colitis ulcerosa, toxikus megacolon), fulmináns vastagbélgyulladás, bélelzáródás, nem előkészített bél, nemrégiben elvégzett gasztrointesztinális anasztomózis, akut has.
Általános ellenjavallatok:
Nem éhgyomrú páciens, súlyos légzési elégtelenség, a járatok akut perforációja, elsődleges endoszkópia, kolonoszkópia, rektoszkópia; szepszis, várandósság.
Továbbá az antikoagulánsokat vagy antiaggregánsokat használó páciensek esetén az endoszkópos orvosnak és a kardiológusnak meg kell állapítania a kockázat/előny arányt.