Mogelijke complicaties bij elektrische stroomtoepassing zijn perforatie en bloeding.Permanente en/of ernstige bijwerkingen van Sfincterotoom/Papillotoom houden verband met de meest voorkomende complicaties van endoscopische retrograde cholangiopancreatografie (ERCP) en endoscopische biliaire sfincterotomie, waaronder: acute pancreatitis, bloeding/bloeding na sfincterotomie, sepsis van galoorsprong (cholangitis en cholecystitis), en duodenumperforatie.